У Німеччині провідні клініки, такі як "Асклепіос Госпіталь Бармбек", Асоціація клінік Дюссельдорфа і Клінічний комплекс Нордрайн-Вестфален, займаються лікуванням циститу. У клініці "Асклепіос" у Бармбеку щорічно проходять лікування понад 80 000 пацієнтів. Асоціація клінік Дюссельдорфа обслуговує понад 200 000 пацієнтів на рік, у ній працюють понад 60 професорів-експертів. Клінічний комплекс Нордрайн-Вестфален, акредитований організацією " Співпраця за прозорість і якість у сфері охорони здоров'я", щорічно обслуговує понад 145 000 пацієнтів, спеціалізуючись на роботизованій хірургії та урології.
Інноваційні методи лікування циститу в Німеччині включають інстиляційну терапію сечового міхура, лазерну абляцію, нейромодуляцію і трансуретральну резекцію, що призводить до високих показників успіху. В одному з досліджень відзначається успіх одноразового щоденного прийому таблеток ципрофлоксацину з пролонгованим вивільненням, а багатообіцяючі результати описані тут.